免费论文摘要：娃娃鱼生殖腺转录组领会及性别确定和分裂基因的挑选

    娃娃鱼（Andrias davidianus）是我国私有的有尾两栖类，属于国度II级中心养护野灵巧物。跟着娃娃鱼人为繁育本领的冲破，娃娃鱼繁育动作一种新兴特种渔产繁育业振奋兴盛，但人为繁育沿用井水豢养引导娃娃鱼性别比率重要失调，且绝大普遍个别为雄鲵。为此，本试验室自2011年起贯串4年运用外源雌二醇对居于生殖腺分裂敏锐期的幼鲵举行处置，截止贯串4年使得幼鲵十足分裂为雌性。由此看来，幼鲵在生殖腺分裂期对外界情况变革很敏锐。但对于外界情况变革惹起幼鲵向各别性别分裂的机理及娃娃鱼性别确定的分子体制等一系列宏大表面题目，暂时仍旧摆在课题组的眼前。    基于转录组学接洽在性别确定和生殖腺分裂上面具备较大的后劲，正文经过对娃娃鱼未分裂生殖腺UD、雌性生殖腺F和雄性生殖腺M样品举行高通量转录组测序，旨在挑选出与娃娃鱼性别确定和分裂关系的分别表白基因，赢得在生殖腺中明显富集的新陈代谢通路，为建立娃娃鱼性别确定和分裂的基因调节和控制搜集、商量娃娃鱼的生殖腺分裂及性别确定的分子体制等接洽处事积聚普通试验数据，也为娃娃鱼财产的可连接安康兴盛及娃娃鱼这个陈旧物种的种族连接供给表面按照。    重要接洽截止和论断如次：    1. 经过Illumina Hiseq2000平台测序，共产出24,623,084,880 nt数据。样品M、F、UD的转录组搀和拼接后赢得146,292个总Unigene，经过Blast比对，解释到NR、NT、Swiss-prot、KEGG、COG及GO中的Unigene序列辨别为57,862、36,773、45,054、42,365、16,960、29,268条。一切解释上的Unigene序名列62,102条，占到了总Unigene的42.5%。    2. 基因表白分别领会后表露，娃娃鱼UD-vs-M公有22,544个分别表白基因，对立于UD，M表白量上调的分别基因数目有7,907个，表白量下调的分别基因数目有14,637个；UD-vs-F公有34,800个分别表白基因，对立于UD，F表白量上调的分别基因有16,751个，表白量下调的分别基因数目有18,049个；M-vs-F公有29,530个分别表白基因，对立于M，F表白量上调的分别基因数目有17,240个，表白量下调的分别基因数目有12,290个。    3. 经过对分别表白基因举行GO功效和Pathway明显性富集，发端领会娃娃鱼3个生殖腺样品中分别表白基因的重要功效及其介入的重要生物化学新陈代谢道路和旗号转导道路。挑选到了囊括类固醇荷尔蒙底栖生物合成、孕酮开辟卵母细胞老练通路等在前的与娃娃鱼生殖腺分裂关系的通路，并对类固醇荷尔蒙底栖生物合成通路中似是而非Hsd17b3和Cyp19a基因在UD和M中的分别表白举行了发端领会。    4. 从分别表白基因的GO功效富会合，挑选到与娃娃鱼性别确定关系的分别表白基因，重要囊括Dmrt1、Fgf9、Wnt-4、Foxl2等，并对其举行了功效刻画。个中，挑选到与雄性性别确定相关的共通基因有Dmrt1、Fgf9，与雌性性别确定关系的共通基因有Wnt-4，齐头并进一步领会了它们在娃娃鱼3个生殖腺样品中的表白分别。其余，还挑选到少许似是而非与娃娃鱼性别确定关系的其余基因，如Dmrt2、Tcf21、Foxl2等。    5. 从分别表白基因的GO功效富会合，挑选到与娃娃鱼性别分裂关系的局部分别表白基因，重要囊括Dmrt1、Dmrt2、Fgf8、Wnt-4、Fst、Dmc1等，并对那些基因举行了功效刻画。个中，挑选到与雄性性别分裂相关的共通基因是Dmrt1，与雌性性别分裂关系的共通基因是Wnt-4、Fsh-R，并领会了Fsh-R基因在娃娃鱼3个生殖腺样品中的表白分别。其余，还挑选到少许似是而非与娃娃鱼性别分裂关系的其余基因，如Dmrt2、Fgf8、Fst、Dmc1等。

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