论文摘要：两种螽斯线粒体全基因组序列测定及谱系基因组学分析

      螽斯总科昆虫隶属于直翅目螽亚目，是螽亚目 中最大的一个类群，目前已知大约有7000多种。目前在GenBank数据库中收录的螽斯总科线粒体全基因组序列20条。本研究通过对PCR扩增产物的测序，获得了中华翡螽（Phyllomimus sinicus）和中华赢蛩螽（Nipponomeconema sinica）线粒体基因组近似全序列，对这两种新测定线粒体基因组序列进行了注释。结合数据库中已有的螽亚目其他物种线粒体基因组数据，对螽亚目昆虫的线粒体基因组的碱基组成、蛋白质氨基酸组成、密码子使用情况和遗传距离等进行了比较分析，还对螽亚目昆虫的系统发育关系进行了重建。得到的主要结果如下：

      1. 获得了中华翡螽和中华赢蛩螽的线粒体基因组的长度分别为14884bp、14813bp，均可注释出所有的13个蛋白质编码基因和tRNA、16S rRNA基因、部分12S rRNA基因。中华翡螽、中华赢蛩螽与螽斯总科其他物种具有一致的基因排列顺序。

      2. 中华翡螽和中华赢蛩螽线粒体基因组与螽亚目昆虫线粒体基因组一样，具有明显的碱基偏好性，A+T含量分别为73%、72.8%。在螽亚目昆虫中蛋白质编码基因的碱基偏好性尤为明显，尤其是密码子第三位的碱基偏好性最强，中华翡螽符合这一特征，但是中华赢蛩螽当中第三位密码子的A+T含量比第一第二位要少，而且发现不论是在N链蛋白编码基因，还是J链蛋白编码基因，第三位的密码子A+T含量都是最少的。

      3. 中华翡螽和中华赢蛩螽13个蛋白质编码基因除了COX1的起始密码子分别为ACC、TTA外，全部是以典型的ATN为起始密码子。蛋白质编码基因的终止密码子有三种，分别为TAA、TAG以及不完全的密码子，中华翡螽的终止密码子没有TAG。

      4. 对中华翡螽和中华赢蛩螽这2个物种的22个tRNA基因进行了二级结构预测，2个物种的tRNAser(AGN)均缺失D臂，其余的基因均能形成典型的三叶草型二级结构。同时也对这两个物种的16S rRNA的二级结构进行了预测，两个物种的16S rRNA包含48个茎环结构，两个物种的16S rRNA二级结构的核心部分都比较保守。

      5. 本研究利用四个数据集（全线粒体基因组，蛋白编码基因，tRNA，16S rRNA）两种建树方法（最大似然法，贝叶斯法）构建螽亚目昆虫的系统进化树。与传统的分类结果相近。支持螽亚目分为3个总科：螽斯总科，蝼蛄总科和蟋蟀总科。蟋蟀总科中的蚁蟋科与蝼蛄总科亲缘关系近，不支持蟋蟀总科的单系性。硕螽科与螽斯科聚为一个分支，草螽科、露螽科的单系性不明确。蛩螽科为一个单系群，与螽斯科和草螽科的亲缘关系比较近。虽然中华翡螽的系统进化地位不能确定，但是中华翡螽与露螽科和纺织娘可的亲缘关系非常近。

来源：半壳优胜鲸鱼幸运星转载请保留出处和链接！

本文链接：http://87cpy.com/214446.html