免费论文摘要：朔方花鳅线粒体基因组测序及鳅类体例发育领会

本接洽用LA-PCR与Sub-PCR相贯串的本领测定了朔方花鳅（Cobitis granoei）线粒体基因组序列，并运用底栖生物消息学关系软硬件对其举行了解释和领会，后共同Genbank已颁布的鳅类线粒体基因组数据，对鳅类体例发育联系举行接洽。所得重要论断如次：1. 朔方花鳅线粒体基因组序列长度为16578 bp，共源代码了37个基因，辨别为2个rRNA基因（12SrRNA和16SrRNA），13个卵白质源代码基因（辨别是COⅠ、COⅡ、COⅢ、ATP6、ATP8、ND1、ND2、ND3、ND4、ND4L、ND5、ND6、Cyt b），22个tRNA源代码基因，再有一个非源代码遏制区(D-loop遏制区)。2. 朔方花鳅线粒体基因组碱基构成具备鲜明的A+T偏差性，总A+T含量达55.8%，朔方花鳅D-loop遏制区的A+T含量为64.5%，高于朔方花鳅线粒体基因组全序列总程度。3. 朔方花鳅线粒体基因组13个卵白质源代码基因中，除去COⅠ基因以GTG为开始暗号子外，其他都是以ATG动作开始暗号子；ND1、COⅠ、ATP6、ATP8、ND4L、ND5这6个基因是以实足的TAA运用中断暗号子功效，ND3和ND4是不实足的TA动作中断暗号子，ND2、COⅡ、ND6、COⅢ和Cytb则仅是不实足的T。4. 对朔方花鳅的12SrRNA和16SrRNA全序列的二级构造举行猜测，后比拟创造朔方花鳅的核糖体RNA二级构造顽固，个中朔方花鳅12SrRNA二级构造含有43个茎环构造，朔方花鳅16SrRNA二级构造包括6个构造域和53个茎环构造。5. 朔方花鳅线粒体基因组中tRNA-SerAGY基因的DHU臂爆发缺点和失误，只产生了一个环，其他21个tRNA基因的二级构造均呈典范的三叶草形构造，且都生存确定数目的碱基错配，以G-U错配为最高。6. 朔方花鳅非源代码区D-loop遏制区坐落tRNAPro基因与tRNAPhe基因之间，长度是922 bp，A+T含量达64.5%。朔方花鳅遏制区序列中找到了以次序列：5′端的中断序列TAS（TACATATTA）；朔方花鳅的中心顽固序列区序列CSB-D(TATTACTGGCATCTGTGTA）；CSB-F（ATGTAGTAAGAGACCA）；CSB-E（TCAGGGACAATAATCGTGGGGGT）；朔方花鳅3′端的顽固序列区序列辨别为CSB-1（AGTTAATGTGAATGAATGATGAAAAGA）和CSB-2（CAAACCCCCTTACCCCC），CSB-3（TGTCAAACCCGAAACCA）。7. 经过运用线粒体基因组三组数据集对鳅类举行体例发育领会，领会截止表露：所建的鳅类体例发育树表露的进化分门别类联系与Nalbant在2002年提出的看法较普遍，重要为：1）鳅类中从来划归鳅科的条鳅亚科、花鳅亚科、沙鳅亚科均可提高为科；2）条鳅科与花鳅科的亲缘联系较与沙鳅科近，花鳅科最进化，条鳅科较进化，沙鳅科最为原始；3）梵条鳅属可飞腾为梵条鳅亚科（Vaillantellinae）归入沙鳅科，而非条鳅科。8. 线粒体基因组序列消息在介入众生分门别类及体例发育联系上面能供给很好的佐证，为底栖生物百般性及体例进化接洽供给了一条要害道路。?

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