免费论文摘要：郑氏比蜢线粒体基因组领会及直翅目虫豸线粒体基因组的进化与翅型和生态型的联系接洽

截止2011年4月，在NCBI中已收录的虫豸纲全线粒体基因组序列有240条，个中直翅目虫豸36条，而蜢总科虫豸暂缺。本接洽沿用Long-PCR和sub-PCR相贯串的本领扩大与增加了直翅目蜢总科郑氏比蜢（Pielomastax zhengi）全线粒体基因组序列，并对该线粒体基因组序列举行了测序、组建、解释以及领会。贯串本试验室往日测定的线粒体基因组序列以及从GenBank载入的少许线粒体基因组序列，重逢同本接洽测定的郑氏比蜢线粒体基因组序列，合计50种直翅目虫豸的线粒体基因组序列，划分红四个数据集，运用最大简单法、最大似然法和贝叶斯推广法为这4个数据集建立了MP树、ML树和BI树。按照翅的是非或有无将这50种虫豸分别生长翅型、短翅型和无翅型，还按照生态型将将这50种虫豸分别为树栖型、草栖型和地栖型虫豸，运用PAML4.4软硬件计划了50种虫豸13个卵白源代码基因和共同数据集各自的同义替代速度、非同义替代速度以及同义替代与非同义替代的比值，经过那些领会得出了以次论断：1．郑氏比蜢线粒体基因组序列全长为15602bp，源代码37个基因和一个A+T富集区，37个基因囊括13个卵白源代码基因、22个tRNA基因以及2个rRNA基因。A+T的含量是71.8%，13个卵白源代码基因中最常用的开始暗号子是ATG，其次是 ATC和 ATT。除COⅢ、ND3、CytB和ND1以TAG动作中断暗号子，ND5的中断暗号子为不实足的T外，其他8个卵白源代码基因的中断暗号子都是TAA。22个tRNA除去tRNASer(AGN)外都具备典范的三叶草构造，然而经过在线猜测只获得16个tRNA的二级构造，其他6个都是人为猜测的。参考新疆土蝗2个rRNA的二级构造猜测了郑氏比蜢2个rRNA的二级构造，创造它与蝗总科的二级构造更一致。在A+T富集区创造一段 Poly（T）（T stretch），且能产生一个茎环构造，估计它与线粒体DNA的复制调节和控制相关。2．经过对12棵体例树的领会创造：三种本领建立的体例树基础上沟通，仅有部分分别，BI树与ML树最一致。而且还创造 37genes的共同数据集与13个卵白源代码基因的共同数据集符合于建立高档阶元和初级阶元之间的体例树，而其他2个数据集只符合于建立高档阶元之间的体例树。一切体例树都将蝗亚目虫豸独立聚成一支，大局部体例树将螽亚目虫豸独立聚在一道，其余大局部体例树将螽斯总科的8种虫豸和32种蝗总科虫豸各自聚成一支，基础上扶助它们的单系性，阿曼蚤蝼聚在蝗亚手段最基部，而郑氏比蜢聚在蝗亚手段次基部。3．经过对3组种各别翅型虫豸同义替代与非同义替代比值的接洽，创造无翅型虫豸的Ka/Ks均值比短翅型虫豸的Ka/Ks均值高29.8%(p=0.249)，短翅型虫豸的Ka/Ks均值比长翅型虫豸的Ka/Ks均值高16.8%（p=0.326），无翅型虫豸的Ka/Ks均值比长翅型虫豸的Ka/Ks均值高51.6%（p=0.016）。经过对P值的查看创造无翅型虫豸比长翅型虫豸积聚了更多的非同义渐变，而且到达了统计学上的明显性程度；再对各别生态虫豸的同义替代与非同义替代比值的接洽创造草栖型虫豸和地栖型虫豸比树栖型虫豸积聚了较多的非同义替代，而且一切虫豸的Ka/Ks比值均小于1，所以不妨觉得各别翅型的虫豸或各别生态型的虫豸都体验了各别的采用压力，即这50种虫豸的线粒体进化并非是中性的。

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