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免费论文摘要:大山雀和绿背山雀线粒体基因组序列测定和体例爆发领会

6982 人参与  2022年03月08日 17:47  分类 : 论文摘要  评论

雀形目品种稠密散布普遍,我国就有661种,约占我国鸟类总额的55.7%。 该类群的衍化联系以及各科物种发源题目从来是鸟类学接洽的热门题目,更加是在决定山雀科和长尾山雀科的分门别类位置上存有很大争议。本文华用PCR扩大与增加产品径直测序法测定了大山雀和绿背山雀两种山雀科鸟类线粒体基因组全序列,并贯串本试验室已测的7条及GenBank中收录的39条雀形目鸟类线粒体全基因组序列,辨别沿用MrBayes 3.1.2软硬件、PAUP 4 beta软硬件和RAxML-7.0.3软硬件重修了雀形目局部鸟类体例发育进化树。重要截止如次:1.大山雀线粒体基因组全长为16772 bp,绿背山雀线粒体基因组全长16771 bp,源代码区均有22个转运tRNA基因,13个卵白基因和2个rRNA基因,非源代码区长度辨别为1187bp和1188bp,均惟有一个遏制区。两种鸟类线粒体全基因组的A+T碱基构成格外一致,大山雀为52.1%,绿背山雀为52%。在暗号子运用上面,两种鸟类各自的13个卵白源代码基因的开始暗号子除COⅠ基因暗号子为GTG外,其他的都均为典范的ATG。而中断暗号子的运用中,创造ND4和COⅢ基由于不实足中断暗号子T,其它的为典范的鸟类中断暗号子AGA,TAA, TAG和AGG。2.所接洽物种的7个科之间平衡遗传隔绝为0.515,山雀科与燕科之间为0.319,而与长尾山雀科之间的遗传隔绝为0.539,燕科与长尾山雀科之间为0.484;科内物种之间的遗传隔绝辨别是燕科0.094,鸦科0.211,山雀科0.282,鹟科0.420,莺科0.620,长尾山雀科0.735,山雀科0.329。3.运用贝叶斯法、最大简单法以及赶快似然法对13个卵白质源代码数据集以及ND4&ND5共同数据集建立的体例发育树截止表露,两个数据集的BI树和MP树拓扑构造普遍,而与ML树的拓扑构造稍有分别。总体来说,莺科并非单系群,鸦科,山雀科,长尾山雀科均为单系群。扶助将长尾山雀科与山雀科分别为两个独力的科。ND4&ND5基因建立的体例爆发树在科级程度上阐明雀形目各科体例发育联系时具备较高的功效,在确定水平上不妨代办雀形手段体例爆发联系。

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