免费论文摘要：四种雀形目鸟类线粒体基因组与长尾山雀属比拟线粒体基因组学接洽

动作鸟类中品种最多的类群，雀形目因其样式百般、动作搀杂，从来是鸟类学接洽的热门。暂时雀形手段衍化生存较多争议。动作众生体内的最小的基因组，线粒体基因组常常被用来接洽各别类群间的进化联系。很多对准雀形手段体例发育接洽均在运用线粒体基因。为了制止由单个基因领会所带来的缺点，暂时普遍采用线粒体基因组的全序列对关系类群的体例发育领会。众生线粒体基因组的基因陈设程序在确定阶元内维持宁静，但也有少许众生的线粒体基因组爆发了重排。重排的发盼望制和爆发频次也是人们关心的热门。本接洽经过长PCR和sub-PCR扩大与增加及径直测序法测定了黄眉林雀(Sylviparus modestus)、红头长尾山雀(Aegithalos concinnus talifuensis)、黑眉长尾山雀(Aegithalos bonvaloti)和银喉长尾山雀(Aegithalos caudatus)的全线粒体基因组序列，并参考红原鸡、地山雀和黑顶林莺的线粒体基因组举行了解释和领会。在此普通上共同载入自GenBank数据库的25条及本试验室未公布的7条全线粒体基因组序列，对雀形目鸟类的体例发育联系做了发端商量。结果，简本地归纳了线粒体基因组基因排序在脊椎众生中的变革情景。本接洽的重要截止有：1. 黄眉林雀、红头长尾山雀、黑眉长尾山雀和银喉长尾山雀的全线粒体基因组长度辨别为17086bp、17940bp、17953bp和17938bp，均源代码囊括13个卵白源代码基因、2个rRNA基因和22个tRNA基因在前的37个基因。黄眉林雀的线粒体基因排序与以红原鸡为代办的鸟类线粒体基因组的基因排序普遍，在tRNAGlu与tRNAPhe间有一个非源代码的遏制区。而3种长尾山雀的基因排序则与以黑顶林莺为代办的一类新排序普遍，即除tRNAGlu与tRNAPhe间的遏制区外，在tRNAThr与tRNAPro间再有一个遏制区，两个遏制区的序列基础普遍。2. 这四个物种的13个卵白源代码基因中，除黄眉林雀的COⅠ基因以GTG动作开始暗号子及3种长尾山雀的ND3基因以ATA动作开始暗号子外，其他的基因均以ATG动作开始暗号子。而中断暗号子上面， 4个物种除COⅢ和ND4这2个基因以不实足的T动作中断暗号子外，其他卵白源代码基因以罕见的TAR和AGR动作中断暗号子。3. 在4种鸟类的功效RNA中，tRNA除SerAGY基因均缺点和失误二氢尿嘧啶臂外，其他tRNA的二级构造均能产生典范的三叶草构造，tRNA二级构造中的碱基错配以G-U错配为主；4种鸟的2个rRNA基因的二级构造顽固，茎区序列基础普遍，12S rRNA的二级构造有四个构造域和43个茎区；16S rRNA的二级构造有六个构造域和55个茎区。4. 对暂时已实行测序的5条长尾山雀线粒体基因组的比拟基因组学领会表白：该属不妨分为3群，红头长尾山雀和银喉长尾山雀各成一群，黑眉长尾山雀与银脸长尾山雀构成一群；红头长尾山雀的点名亚种和云南亚种的mtDNA序列分别较大，到达了普遍觉得的种级程度分别，而黑眉长尾山雀与银脸长尾山雀的mtDNA序列分别很小，仅有41个位点的分别；在长尾山雀属中，各别功效区的进化速率纷歧，遏制区与卵白源代码基因的进化速率较快，而tRNA和rRNA的进化速率较慢；在卵白源代码基因的氨基酸酸序列中，银喉长尾山雀的自裔位点较多，估计这与其与该属其余物种的各别存在情况相关。5. 将线粒基因组的37个基因拉拢为3个数据集，辨别用最大简单法、最大似然发和贝叶斯推广法创造体例发育树商量雀形手段体例发育联系。领会截止表白刺鹩和琴鸟的场所比拟特出，前者应是所有雀形手段姊妹群，尔后者是鸣禽亚手段姊妹群；山雀科与莺总科的联系比拟朦胧，应从莺总科中移出，但其近缘类群还不许决定；长尾山雀与山雀科的体例发育联系较远，而与莺科或鹎科的联系较近。6. 对脊椎众生线粒体基因排序的发端领会表白，重排在脊椎众生中并不常见。而重排爆发的热门重要会合在两个复制开始邻近，咱们探求重排局面的爆发很大概与复制开始介导的不平常的复制或这一地区内有DNA内切酶辨别的位点相关。对于证明重排的两种罕见模子，咱们觉得串联反复-随机简略模子能较好地证明相邻基因的场所调换，而重组模子不妨更领会地证明大片断的迁徙等较搀杂的重排。

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