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免费论文摘要:三种长鼻目虫豸线粒体基因组序列的测定及体例发育领会

9571 人参与  2022年02月06日 14:44  分类 : 论文摘要  评论

众生线粒体基因组因为其构造大略、进化速度快、母系遗传和爆发重组率低等特性,己被普遍用来集体遗传学、体例发育重组、比拟和进化基因组学以及基因组水等分子进化等范围的接洽。本接洽运用Sub-PCR本领,测定了太白虎粉蝶 Luehdorfia taibai,Chou,1994、断纹波水螟Paracymoriza distinctalis,(Leech,1889) 和长臂彩丛螟Lista haraldusalis,(Walker,1859) 的线粒体基因组序列,运用关系软硬件举行了组建拼接、解释和领会。共同已公然的局部长鼻目线粒体基因组,鉴于线粒体基因组2个rRNA基因和 13 个卵白质源代码基因全序列数据,辨别沿用最大简单法 (maximum parsimony, MP)、最大似然法 (maximum-likelihood, ML) 和贝叶斯推广法 (bayesian inference, BI) 建立了 6种长鼻目物种的体例爆发树。重要论断如次:1. 本接洽所测定的3种长鼻目虫豸线粒体基因组全长辨别为:太白虎粉蝶15553 bp,断纹波水螟15355 bp,长臂彩丛螟15213 bp。线粒体基因组都由37个基因 (13个卵白质源代码基因,22个tRNA 基因和2 个rRNA 基因) 和1个A+T富集区形成。2. 太白虎粉蝶、断纹波水螟和长臂彩丛螟线粒体基因组的碱基构成具备鲜明的AT偏差性,它们的A+T含量 (J链) 辨别为:太白虎粉蝶81.47%,断纹波水螟82.14%,长臂彩丛螟81.51%。3. 本接洽中COI基因除长臂彩丛螟以特出的四联体TTAG动作开始暗号子外,太白虎粉蝶和断纹波水螟的COI基因都以CGA动作开始暗号子,而其它的卵白质源代码基因均以典范的ATN动作开始旗号。断纹波水螟的COII基因与长臂彩丛螟的COII和ND6基因均以不实足的中断暗号子T动作中断旗号,其它卵白质源代码基因的中断暗号子为TAA或TAG。4. 线粒体基因组的22个tRNA基因,除去太白虎粉蝶和断纹波水螟的tRNASer (AGN) 基因外,其他均可折叠成典范的三叶草型二级构造, tRNA二级构造均生存确定数手段碱基错配局面。太白虎粉蝶线粒体基因组在191-259 bp的场所还生存1个特殊的tRNALeu,功效未知。5. 本接洽3种虫豸的A+T富集区长度辨别为太白虎粉蝶939 bp,断纹波水螟344 bp,长臂彩丛螟310 bp。A+T含量辨别为94.56%、95.06%和96.13%。A+T富集区里面有少许典范的构造,个中囊括一致微卫星的反复序列 (AT)n和(ATT)n,以及 poly-A 和poly-T 构造等。6. 体例发育联系截止表露,(夜蛾总科 + (尺蛾总科+蚕蛾总科)) 聚为姊妹群;梳翅弄蝶动作弄蝶总科独一的数据集代办,在进化联系上表露与粉蝶总科有更近的亲缘联系;天蚕蛾科和天蚕蛾科聚为一个与其它科虫豸平行的单系支。

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