免费论文摘要：五种螟蛾线粒体基因组序列的测定及螟蛾总科体例发育接洽

螟蛾总科是鳞翅手段第二大类群，其大普遍品种都是武林佛及仓库储存益虫，更加是钻蛀类螟蛾。大表面积的虫害给武林佛业形成重要的财经丢失，所以螟蛾类虫豸的防疫从来是关系接洽的中心。跟着分子底栖生物学接洽本领的兴盛，线粒体基因组的接洽在螟蛾总科中渐渐发展，但重要会合在单个的线粒体基因组的特性领会，很罕见对螟蛾总科虫豸的线粒体基因组特性及体例发育联系举行所有深刻的领会。本接洽经过LA-PCR本领贯串引物步移法，对褐巢螟Hypsopygia regina、黄纹银草螟Pseudargyria interruptella、双斑薄翅螟Evergestis junctalis、橙黑纹野螟Tyspanodes striata和豆角儿野螟Maruca vitrata的线粒体基因组序列举行测定，并对上述5种新序列举行解释领会。共同GenBank中已开释的20种螟蛾总科虫豸的线粒体基因组数据，对螟蛾总科虫豸线粒体基因组举行比拟领会，并以卵白质源代码基因（PCGs）为数据集，以雅库巴果蝇Drosophila yakuba为外群，运用最大似然法和贝叶斯推导法对螟蛾总科的体例发育联系举行重修并商量领会。所得重要论断为：1. 褐巢螟、黄纹银草螟、双斑薄翅螟、橙黑纹野螟和豆角儿野螟线粒体基因组全序列长度辨别为15212 bp、15231 bp、15438 bp、15255 bp和15200 bp，个中豆角儿野螟为暂时已测螟蛾总科虫豸实足序列中最短的物种。线粒体基因组的构成和构造与已通讯的螟蛾总科虫豸普遍，为紧闭环状双链DNA分子，囊括13个卵白质源代码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和一个A+T富集区。与长鼻目蝙蝠蛾等原始类群虫豸比拟，tRNAMet基因的陈设程序有分辨，即由tRNAIle-tRNAGln -tRNAMet变为tRNAMet-tRNAIle -tRNAGln。2. 双斑薄翅螟全线粒体基因组，除A+T富集区非源代码区外，在基因tRNAAla和tRNAArg、ND3和tRNAAla之间辨别生存114 bp和62 bp的基因间隙，其均为插入的串联反复序列；在tRNAPro和ND6之间生存长达88 bp的基因臃肿序列。3. 5种螟蛾线粒体基因组的碱基构成均具备鲜明的AT偏差性，个中褐巢螟的AT含量较低，为78.65%；橙黑纹野螟的AT含量最高，为81.38%；豆角儿野螟、黄纹银草螟和双斑薄翅螟的AT含量辨别为80.86%、79.40%和81.08%。4. 卵白质源代码基因的开始暗号子的运用情景：5种螟蛾的COI基因均以CGA开始，其他基因则以ATN开始；中断暗号子的运用：5种螟蛾的COII基因都以独立的T中断，黄纹银草螟的ND5基因以不实足中断暗号子TA中断，其余的PCGs则以实足中断暗号子TAN中断。5. 5种螟蛾的tRNA二级构造，除基因tRNASer(AGN)的二级构造缺DHU臂外，其他21个tRNA均能产生典范的三叶草构造。且tRNA二级构造生存确定数目的碱基错配，囊括U-U和G-U两种典型，重要为G-U错配。6. 5种螟蛾的A+T富集区具备极高的AT含量，褐巢螟、黄纹银草螟、双斑薄翅螟、橙黑纹野螟和豆角儿野螟辨别为94.86%、90.99%、94.30%、94.51%和93.62%。而且5种虫豸的A+T富集区中均生存关系的顽固元件ATTTA、ATAG、poly-T及是非纷歧的微卫星构造。7. 已知25种螟蛾的PCGs的暗号子UUA(L)、AUU(L)、UUU(F)、AUA(M)的运用频次较高，平衡为465.4、415.5、344.5、256.5。PCGs的氨基酸酸运用情景与暗号子运用情景普遍，运用量从高到低顺序为亮氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸、蛋氨酸。8. ML法和BI法建立的体例发育树的拓扑构造大概沟通，与保守分门别类普遍，两棵体例发育树都很好的扶助了草螟科和螟蛾科的单系性，同声再有力地扶助了树立所囊括的11个亚科（螟蛾科4亚科，草螟科7亚科）的单系性，在ML体例树中，各个亚科的对立场所展现为：((((斑螟亚科+螟蛾亚科)+丛螟亚科)+蜡螟亚科)+((((草螟亚科+苔螟亚科)+禾螟亚科)+(水螟亚科+薄翅螟亚科))+(斑野螟亚科+野螟亚科)))。

来源：半壳优胜育转载请保留出处和链接！

本文链接：http://87cpy.com/210804.html