免费论文摘要：7种鸡形目鸟类线粒体基因组的比拟及谱系基因组学接洽

鸡形目是鸟类中一个要害类群，与生人生存联系出色。固然已有很多鸿儒沿用各别典型数据对鸡形手段体例发育联系举行了接洽，然而因为该类群局部分支体验了赶快的符合辐射，鸡形目里面的体例发育联系仍生存争议。连年来，线粒体基因组序列被普遍应用到鸡形目多个层面包车型的士接洽中，并被觉得是重修鸡形目体例发育联系和进化汗青的一个灵验东西。本接洽测定了7种鸡形目物种（海南山鹧鸪、中华鹧鸪、斑尾榛鸡、褐马鸡、白马鸡、灰山鹑和暗腹雪鸡）的线粒体基因组序列，共同数据库已有的其余鸡形目鸟类线粒体基因组序列，沿用比拟基因组学、谱系基因组学本领对鸡形目各类群举行了领会。获得的重要论断如次：1. 7种鸡形目鸟类线粒体基因组长度介于16658-16730bp之间，源代码37个基因（13个卵白源代码基因，2个rRNA基因和22个tRNA基因），附加1个遏制区。线粒体基因组构成和基因排序与其余已公布的鸡形目鸟类普遍。2. 鸡形目山鹧鸪属、榛鸡属、马鸡属、山鹑属和雪鸡属的属内比拟接洽创造，同一属内物种的线粒体基因组碱基构成、偏差性、暗号子运用频次、RNA二级构造、遏制区构造等上面一致。除马鸡属局部基因外，其余属卵白源代码基因的Ka/Ks值均小于1，表露出遭到了纯化采用效率。3. 鸡形目鸟类的线粒体基因组长度介于16658-16841bp之间，平衡长度为16705bp；个中，原鸡属线粒体基因组序列对立较长。鸡形目鸟类线粒体基因组A+T含量略高于G+C含量，且生存弱的A-偏私和鲜明的C-偏私。J链源代码的基因具备A/C-偏私，而N链源代码的基因具备T/G-偏私。卵白源代码基因中，暗号子第3位点具备鲜明的A/C-偏私。4. 鸡形目线粒体基因组卵白源代码基因优先采用NNM典型的暗号子。12S rRNA二级构造中3个构造域的顽固性一致；16S rRNA二级构造的6个构造域中，构造域IV和V的序列对立较顽固，而构造域VI和III变异较大。除tRNASer(AGY)缺点和失误DHU臂外，其余tRNA均可产生典范的三叶草二级构造。D-loop的3个构造域中，构造域II的顽固性高于构造域I和III；鸡形目局部物种的D-loop包括串联反复序列。5. 鸡形目线粒体基因组之间的遗传隔绝（P-隔绝）介于0.001-0.197之间；除鹑属外，其余属的属内P隔绝均小于属间P隔绝。6. 鸡形目7个科的体例发育联系为((((((松鸡科+火鸡科)+雉科)+齿鹑科)+珠鸡科)+凤冠雉科)+冢雉科)。个中，冢雉科坐落鸡形手段基部场所；松鸡科和火鸡科镶嵌在雉科里面；山鹧鸪属和锈红林鹧鸪分支坐落雉科的基部场所。不扶助雉类和鹑类的单系性。7. 鸡形目鸟类最早的分裂爆发在晚白垩纪。雉科物种的发源和分裂均出此刻始新世。雉科里面属的百般化早在始新世就仍旧发端，且在渐新世和中新世阶段连接夸大。青藏高原凸起和第四纪气象振动感化了局部雉科物种（例马鸡属）的发源和进化。8. 线粒体基因组体例发育消息量重要根源于卵白源代码基因，个中，暗号子第3位点具备较高的体例发育旗号。鸡形目体例发育重修进程中，数据分别需商量基因典型、源代码链及暗号子各别位点等成分。

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